一、itraq(tmt)-多通量定量分析服務(wù)簡介：
itraq (isobaric tag for relative and absolute quantitation) 和 tmt(tandem mass tag) 分別是由ab sciex和thermo scientific公司分別開發(fā)的、對trypsin酶解肽段進(jìn)行標(biāo)記的試劑盒。標(biāo)記肽段通過lc-ms，能同時實(shí)現(xiàn)對蛋白質(zhì)的鑒定和對蛋白質(zhì)的相對定量分析。
itraq和tmt的技術(shù)原理*一樣，區(qū)別在于：（1）生產(chǎn)商不同；（2）分子結(jié)構(gòu)稍有差異；（3）標(biāo)記通量有差異。itraq有4標(biāo)（4-plex）和8標(biāo)（8-plex）2種規(guī)格，tmt有2標(biāo)（2-plex）、6標(biāo)（6-plex）和10標(biāo)（10-plex）等3種規(guī)格。itraq/tmt標(biāo)記通量多樣，為實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供了更多的選擇性，有利于用戶根據(jù)自己的樣品數(shù)量，選擇合適的標(biāo)記方案。
itraq/tmt技術(shù)的優(yōu)勢是能同時分析8-10組樣品，實(shí)驗(yàn)周期短。但其不足體現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)步驟多，系統(tǒng)誤差較大。
整體服務(wù)方案：
客戶只需提供樣本即可。我方負(fù)責(zé)完成后續(xù)所有實(shí)驗(yàn)，包括：
蛋白質(zhì)提取與trypsin酶解。
酶解肽段itraq/tmt標(biāo)記與混合。
混合肽段hplc分離，收集餾分。
對每個餾分進(jìn)行l(wèi)c-ms測試。
ms數(shù)據(jù)定性及定量分析，篩選差異表達(dá)的蛋白質(zhì)。
差異表達(dá)蛋白常規(guī)生物信息學(xué)分析。
我方該服務(wù)的優(yōu)勢體現(xiàn)在：（1）樣品通常分為15個餾分；（2）每個流程lc-ms測試時間為2h，共計(jì)測試15×2=30h。餾分和測試時間的增加，能顯著提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目和蛋白質(zhì)定量的準(zhǔn)確度。