菌核病是矢車菊的主要病害，雨季發(fā)病嚴重。它通過病株與健壯株間的接觸和土壤內(nèi)菌絲體的生長蔓延傳播。病害先從基部發(fā)生，感病初期呈水漬狀軟腐，并密生白色的絮狀物，后呈褐色，逐漸向莖和葉柄處擴展。后期，莖內(nèi)外可見黑色的菌核。防治方法： ①種植時株行距不宜過密，土質(zhì)要求疏松與排水良好。
②噴施藥劑。發(fā)病初期可用25%粉銹寧可濕性粉劑2500倍液噴灑，或800倍液70%甲基托布津可濕性粉劑噴灑。
③清除病株。感病嚴重病株要及時去除并處理掉，以減少侵染源。
④注意種植地。為了防止菌核病感染，種植地要避免與十字花科植物輪作。