搖瓶水平到反應(yīng)器水平的配方優(yōu)化
從實驗室放大到中試規(guī)模，后到工業(yè)生產(chǎn)，放大效應(yīng)會產(chǎn)生各種各樣的問題。從搖瓶發(fā)酵放大到發(fā)酵罐水平，有很多不同之處：@消毒方式不同。搖瓶是外流蒸汽靜態(tài)加熱（大部分是這樣的）；發(fā)酵罐是直接蒸汽動態(tài)加熱，部分是直接和蒸汽混合，因此會影響發(fā)酵培養(yǎng)基的質(zhì)量、體積、ph、透光率等指標。
②接種方式不同。搖瓶是吸管加入；發(fā)酵罐是火焰直接接種（當然有其他的接種方式），要考慮接種時的菌株損失和菌種的適應(yīng)性等。
③空氣的通氣方式不同。搖瓶是表面直接接觸；發(fā)酵罐是和空氣混合接觸，要考慮二氧化碳的濃度和氧氣的溶解情況。
④蒸發(fā)量不同。搖瓶的蒸發(fā)量不好控制，濕度控制好的話，蒸發(fā)量會少；發(fā)酵罐蒸發(fā)量大，但是可以通過補料解決。
⑤攪拌方式不同。搖瓶是以搖轉(zhuǎn)方式進行混合攪拌，對菌株的剪切力較??；發(fā)酵罐是直接機械攪拌，要注意剪切力的影響。
⑥ph的控制方法不同。搖瓶般通過加入碳酸鈣和間斷補料控制ph；發(fā)酵罐可以直接流加酸堿控制ph，比較方便。
⑦溫度的控制方法不同。搖瓶是空氣直接接觸或者傳熱控制溫度；但是發(fā)酵罐是蛇罐或者夾套水降溫控制，應(yīng)注意降溫和加熱的影響。
③染菌的控制方法不同。發(fā)酵罐根據(jù)染菌的周期和染菌的類型等可以采取些必要的措施減少損失。
④檢測的方法不同。搖瓶因為量小不能方便地進行控制和檢測；發(fā)酵罐可以取樣或者儀表時時檢測。
①原材料不同。發(fā)酵罐所用原材料比較廉價而且粗放，工藝控制和搖瓶區(qū)別很大等。
由于搖瓶水平和發(fā)酵罐水平存在多方面的區(qū)別，搖瓶水平的適培養(yǎng)基和發(fā)酵罐水平的培養(yǎng)基往往也是有區(qū)別的。搖瓶優(yōu)化是培養(yǎng)基設(shè)計的步，搖瓶優(yōu)化配方般用在菌種的篩選，以及作為進步反應(yīng)器水平上研究的基礎(chǔ)，從反應(yīng)器水平的培養(yǎng)基優(yōu)化可以得出終的發(fā)酵基礎(chǔ)配方。例如，發(fā)酵搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基的配方為：玉米漿4%，乳糖10%，（nh4）2so40.8%，輕質(zhì)碳酸鈣1%；優(yōu)化后發(fā)酵罐培養(yǎng)基為：葡萄糖流加控制總量10%~15%，玉米漿總量4%~8%，補加硫酸、前體等。