和芍藥的最大區(qū)別在于牡丹是灌木，木牡丹質(zhì)莖，而芍藥則是宿根草本，革質(zhì)莖。其它的區(qū)別還有：牡丹葉片寬厚，正面綠色綠色略呈黃色，而芍藥葉片狹薄，糧棉均濃綠色；牡丹的花朵著生于花枝頂端，花徑一般在20厘米左右；而芍藥花單生枝頂或近頂端葉腋花徑在15厘米左右。另外，牡丹一般在4說中下旬開花，而芍藥則在5月上中旬開花，牡丹比芍藥早半個月左右開花。
牡丹
最明顯的區(qū)別就是牡丹為木本，芍藥為草本。葉片形狀不同，芍藥小葉為三個裂片，牡丹三回三出復(fù)葉。花軸不同，牡丹花軸短，芍藥花軸長。
芍藥
芍藥：毛莨科，多年生草本，又名沒骨花，莖高三尺。復(fù)葉，各小葉深裂為三片。春夏開花，單瓣或復(fù)瓣，有紅、紫、黃、白各色。《本草》謂：芍藥猶綽約也，美好貌。此草花容綽約，故以為名。芍藥原產(chǎn)我國，《詩經(jīng)》便有維士與女，伊其相謔，贈之以芍藥之句?！峨x騷》中的留夷，亦即芍藥。此花又稱花相，今群芳中牡丹為第一，芍藥為第二，故世稱牡丹為花王，芍藥為花相。
牡丹生長緩慢，株型小，株高多在0.5～2米之間；根肉質(zhì)，粗而長，中心木質(zhì)化，長度一般在０.5～0.8米，極少數(shù)根長度可達(dá)2米；根皮和根肉的色澤因品種而異；枝干直立而脆，圓形，為從根莖處叢生數(shù)枝而成灌木狀，當(dāng)年生枝光滑、草木，黃褐色，常開裂而剝落；葉互生，葉片通常為三回三出復(fù)葉，枝上部常為單葉，小葉片有披針、卵園、橢園等形狀，頂生小葉常為2～3裂，葉上面深綠色或黃綠色，下為灰綠色，光滑或有毛；總?cè)~柄長8～20厘米，表面有凹槽；花單生于當(dāng)年枝頂，兩性，花大色艷，形美多姿花徑10～30厘米；花的顏色有白、黃、粉、紅、紫紅、紫、墨紫（黑）、雪青（粉藍(lán)）、綠、復(fù)色十大色；雄雌蕊常有瓣化現(xiàn)象，花瓣自然增多和雄、雌蕊瓣化的程度與品種、栽培環(huán)境條件、生長年限等有關(guān)；正?；ǖ男廴锒鄶?shù)，結(jié)籽力強(qiáng)，種籽成熟度也高，雌蕊瓣化嚴(yán)重的花，結(jié)籽少而不實或不結(jié)籽，完全花雄蕊離生，心皮一般5枚，少有8枚，各有瓶狀子房一室，邊緣胎座，多數(shù)胚珠，骨果五角，每一果角結(jié)籽7～13粒，種籽類圓形，成熟時為共黃色，老時變成黑褐色，成熟種子直徑0.6～0.9厘米，千粒重約400克