1、對于取消退稅率的貨物出口或者因違反出口退(免)稅相關(guān)規(guī)定被征稅的業(yè)務(wù)，需要根據(jù)納稅義務(wù)時點判斷何時申報增值稅。具體來說，根據(jù)增值稅暫行條例和實施細(xì)則的規(guī)定，結(jié)合銷售合同約定的收款時間來確定何時需要履行納稅義務(wù)。一旦達(dá)到納稅義務(wù)的條件，在達(dá)到納稅義務(wù)的次月申報期內(nèi)申報增值稅，不要提前申報以避免提前占用稅款資金。如果需要開具增值稅普通發(fā)票，那么在達(dá)到納稅義務(wù)的當(dāng)月內(nèi)開具發(fā)票。
需要注意的是，計算不含稅銷售額時，根據(jù)財稅(2012) 39號的規(guī)定，出口貨物適用征稅政策時，不含稅銷售額等于離岸價(即fob金額)乘以匯率除以(1+稅率)，銷項稅額等于離岸價(即fob金額)乘以匯率乘以稅率除以(1+稅率)。如果涉及進(jìn)料加工復(fù)出口業(yè)務(wù)需要征稅，還需要從貨物離岸價中扣除包含保稅料件的金額，然后按差額計算銷項稅額。
對于征稅業(yè)務(wù)相應(yīng)的進(jìn)項稅額申報抵扣，生產(chǎn)企業(yè)可以直接抵扣外貿(mào)企業(yè)購入時獲得的專用發(fā)票。如果已經(jīng)進(jìn)行了退稅勾選并確認(rèn)，需要撤銷退稅勾選并申請回退，然后再重新進(jìn)行抵扣勾選。在外貿(mào)企業(yè)購入貨物時無法區(qū)分出口和內(nèi)銷情況的情況下，需要申請出口貨物轉(zhuǎn)內(nèi)銷證明來抵扣進(jìn)項稅額。
2、在申報增值稅時，應(yīng)注意以下事項：
① 納稅義務(wù)時點應(yīng)根據(jù)合同約定的收款時間來確認(rèn)，不要提前或延遲申報，以免造成滯納金。
② 對于外幣報關(guān)的情況，在將其折算為人民幣銷售額時，折算匯率應(yīng)根據(jù)納稅義務(wù)時點(或達(dá)到納稅義務(wù)時點當(dāng)月一號)來確認(rèn)，而不能再按出口月份一號來計算。
3、在開具增值稅發(fā)票時，應(yīng)注意以下事項：
① 開票時間應(yīng)在達(dá)到納稅義務(wù)的月份內(nèi)進(jìn)行開具，不要提前開票。
② 在開具發(fā)票時，應(yīng)根據(jù)貨物的適用稅率直接選擇稅率。
③ 對于已經(jīng)開具了免稅或0%稅率發(fā)票的情況，如果發(fā)生視同內(nèi)銷而需要調(diào)整增值稅申報數(shù)據(jù)，可以選擇沖銷原發(fā)票并按適用稅率重新開具，或者在不重新開具的情況下調(diào)整增值稅申報數(shù)據(jù)。